Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2L3Q9Y4A8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFE2L3Q9Y4A8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms