Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms