Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R2

PTPN22, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 22, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22Q9Y2R2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN22Q9Y2R2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN22Q9Y2R2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms