Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL20Q9Y2M5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms