Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC2Q9Y235 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms