Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCML2Q9UQR0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms