Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP164Q9UPV0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CEP164Q9UPV0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP164Q9UPV0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms