Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1RE1Q9UN81 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms