Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms