Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX12Q9UMY4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms