Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDH9Q9ULB4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH9Q9ULB4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms