Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMFRQ9UKV5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AMFRQ9UKV5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms