Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNL1Q9UK58 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms