Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA1Q9UJY5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms