Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MID2Q9UJV3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms