Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL4Q9UJQ4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms