Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH22Q9UJ99 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms