Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAI1Q9UI46 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAI1Q9UI46 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms