Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2IRD1Q9UHL9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms