Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSFQ9UBX1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms