Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0N8

MARCH2, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH2, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH2Q9P0N8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH2Q9P0N8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH2Q9P0N8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms