Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI5

GRHL1, Grainyhead-like protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL1Q9NZI5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL1Q9NZI5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL1Q9NZI5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms