Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PODXL2Q9NZ53 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms