Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 CPOX-204ENST00000513674 826 ntTSL 528.22■■■□□ 2.111e-9■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.043e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.022e-11■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.013e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.943e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.933e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.71e-9■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-219ENST00000555987 557 ntTSL 425.62■■□□□ 1.695e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-221ENST00000556600 751 ntTSL 325.62■■□□□ 1.695e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 SF1-221ENST00000633899 591 ntTSL 425.38■■□□□ 1.653e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.643e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.623e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 OTUD5-205ENST00000455452 2077 ntTSL 524.71■■□□□ 1.553e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 SPN-205ENST00000563039 1853 ntTSL 523.19■■□□□ 1.33e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.173e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 SPN-203ENST00000436527 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.26■■□□□ 1.153e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.093e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 CYBRD1-207ENST00000494587 549 ntTSL 421.49■■□□□ 1.033e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 SF1-212ENST00000463343 983 ntTSL 221.47■■□□□ 1.033e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.015e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.943e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.883e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 SF1-207ENST00000413951 623 ntTSL 220.37■□□□□ 0.853e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 SF1-215ENST00000482693 755 ntTSL 220.27■□□□□ 0.843e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 CYBRD1-205ENST00000468308 763 ntTSL 319.29■□□□□ 0.683e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 CYBRD1-206ENST00000474182 465 ntTSL 518.48■□□□□ 0.553e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-213ENST00000554818 552 ntTSL 318.21■□□□□ 0.515e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.463e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-215ENST00000555307 1039 ntTSL 516.9■□□□□ 0.35e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.295e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-209ENST00000554315 1740 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.265e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.193e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-230ENST00000557774 847 ntTSL 215.72■□□□□ 0.115e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 LINC01667-201ENST00000623554 1137 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.073e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-222ENST00000556700 529 ntTSL 413.96□□□□□ -0.175e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 CYBRD1-202ENST00000375252 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.233e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.375e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-206ENST00000553415 694 ntTSL 412.64□□□□□ -0.395e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-202ENST00000356296 3453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.415e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 CYBRD1-201ENST00000321348 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 OTUD5-207ENST00000484499 924 ntTSL 511.54□□□□□ -0.563e-6■■□□□ 13.7
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AATFQ9NY61 NUMB-210ENST00000554394 954 ntTSL 310.17□□□□□ -0.785e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.955e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.093e-6■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.215e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 NUMB-220ENST00000556112 568 ntTSL 45.18□□□□□ -1.585e-8■■□□□ 13.7
AATFQ9NY61 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.973e-6■■□□□ 13.6
AATFQ9NY61 TAF1D-212ENST00000529794 1123 ntTSL 23.03□□□□□ -1.923e-80■■□□□ 13.5
AATFQ9NY61 TAF1D-218ENST00000533794 505 ntTSL 22.21□□□□□ -2.063e-80■■□□□ 13.5
AATFQ9NY61 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.239e-7■■□□□ 13.5
AATFQ9NY61 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.139e-7■■□□□ 13.5
AATFQ9NY61 UBC-208ENST00000540700 627 ntTSL 220.16■□□□□ 0.829e-7■■□□□ 13.5
AATFQ9NY61 UBC-204ENST00000536661 624 ntTSL 218.29■□□□□ 0.529e-7■■□□□ 13.5
AATFQ9NY61 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.379e-7■■□□□ 13.5
AATFQ9NY61 UBC-213ENST00000546120 718 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.599e-7■■□□□ 13.5
AATFQ9NY61 UBC-211ENST00000542416 517 ntTSL 410.97□□□□□ -0.659e-7■■□□□ 13.5
AATFQ9NY61 GLUL-206ENST00000462444 793 ntTSL 210.95□□□□□ -0.664e-7■■□□□ 13.5
AATFQ9NY61 BSG-212ENST00000590218 545 ntTSL 223.44■■□□□ 1.342e-6■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.022e-6■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 BSG-207ENST00000573216 545 ntTSL 420.9■□□□□ 0.942e-6■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 BSG-210ENST00000576925 611 ntTSL 220.9■□□□□ 0.942e-6■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.852e-6■■□□□ 13.4
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AATFQ9NY61 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.822e-6■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.812e-6■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 319.05■□□□□ 0.642e-6■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.632e-6■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 BSG-206ENST00000572899 582 ntTSL 218.88■□□□□ 0.612e-6■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.371e-7■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.231e-7■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.181e-7■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.111e-7■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.071e-7■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.031e-7■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 EIF4G1-221ENST00000441154 4311 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-7■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.371e-323■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.751e-323■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 SNORA74B-201ENST00000391100 201 ntBASIC11.43□□□□□ -0.581e-323■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.111e-323■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.574e-6■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 MKNK2-205ENST00000586828 1503 ntTSL 223.84■■□□□ 1.414e-6■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.44e-6■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.284e-6■■□□□ 13.4
AATFQ9NY61 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.872e-53■■□□□ 13.3
AATFQ9NY61 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.147e-10■■□□□ 13.3
AATFQ9NY61 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.167e-10■■□□□ 13.3
AATFQ9NY61 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.23■■■□□ 2.591e-323■■□□□ 13.3
AATFQ9NY61 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.245e-7■■□□□ 13.3
AATFQ9NY61 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.955e-7■■□□□ 13.3
AATFQ9NY61 HBP1-209ENST00000478930 563 ntTSL 47.23□□□□□ -1.255e-7■■□□□ 13.3
AATFQ9NY61 HBP1-205ENST00000464009 478 ntTSL 53.92□□□□□ -1.785e-7■■□□□ 13.3
AATFQ9NY61 DAZAP1-206ENST00000587833 560 ntTSL 512.55□□□□□ -0.42e-6■■□□□ 13.2
AATFQ9NY61 DGCR8-204ENST00000457069 770 ntTSL 321.45■■□□□ 1.029e-10■■□□□ 13.2
AATFQ9NY61 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.063e-6■■□□□ 13.2
AATFQ9NY61 RPL32-203ENST00000396957 1749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.453e-6■■□□□ 13.2
AATFQ9NY61 RPL32-204ENST00000429711 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.543e-6■■□□□ 13.2
AATFQ9NY61 RPL32-201ENST00000273223 567 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.613e-6■■□□□ 13.2
AATFQ9NY61 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.123e-6■■□□□ 13.2
AATFQ9NY61 RPL32-207ENST00000452606 631 ntTSL 27.77□□□□□ -1.173e-6■■□□□ 13.2
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