Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL11Q9NVR0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms