Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms