Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASSF1Q9NS23 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms