Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I1-206ENST00000457059 2393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.732e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MGAT4D-202ENST00000509091 484 ntTSL 210.49□□□□□ -0.732e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MAP1LC3B2-203ENST00000625301 605 ntTSL 510.42□□□□□ -0.742e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC1-205ENST00000572656 409 ntTSL 210.42□□□□□ -0.742e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MGAT4D-209ENST00000515402 448 ntTSL 310.42□□□□□ -0.742e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 FHIT-207ENST00000490952 1720 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MAPK3-210ENST00000481230 465 ntTSL 510.27□□□□□ -0.772e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.772e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 RASGRF1-206ENST00000560334 4187 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.772e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 BCO2-208ENST00000526088 1983 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.792e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MGAT4D-206ENST00000513106 3783 ntTSL 510.09□□□□□ -0.792e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 RPS11-207ENST00000601216 602 ntTSL 410.09□□□□□ -0.792e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 FKBP9-207ENST00000471066 591 ntTSL 49.99□□□□□ -0.812e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.822e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LAT-215ENST00000568899 701 ntTSL 29.81□□□□□ -0.842e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 SKAP2-201ENST00000345317 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 COG5-205ENST00000464542 897 ntTSL 39.62□□□□□ -0.872e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 PRR14L-205ENST00000432485 3308 ntTSL 29.5□□□□□ -0.892e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 NR2C2-211ENST00000478572 2767 ntTSL 29.39□□□□□ -0.912e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 BCO2-201ENST00000357685 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.912e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MXI1-210ENST00000485566 2755 ntTSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC1-202ENST00000540486 759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.922e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC1-203ENST00000571739 648 ntTSL 39.32□□□□□ -0.922e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.957e-24■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ZBTB38-208ENST00000509813 855 ntTSL 39.08□□□□□ -0.962e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ZFR-205ENST00000507465 1140 ntTSL 59.03□□□□□ -0.967e-24■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TTPAL-205ENST00000461134 3455 ntTSL 28.89□□□□□ -0.992e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I1-209ENST00000519371 774 ntTSL 48.81□□□□□ -12e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC3-206ENST00000469757 221 ntTSL 28.8□□□□□ -12e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 REV3L-208ENST00000460981 441 ntTSL 28.73□□□□□ -1.012e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 RPS11-209ENST00000602252 751 ntTSL 28.61□□□□□ -1.032e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 RERE-207ENST00000464972 743 ntTSL 58.58□□□□□ -1.042e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.082e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 BCO2-217ENST00000532716 711 ntTSL 28.3□□□□□ -1.082e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TTPAL-204ENST00000456317 926 ntTSL 28.26□□□□□ -1.092e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 RPS11-208ENST00000601306 547 ntTSL 38.25□□□□□ -1.092e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 FKBP4-205ENST00000543037 727 ntTSL 28.13□□□□□ -1.112e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 NIT2-205ENST00000478856 1655 ntTSL 28.12□□□□□ -1.112e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.122e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LINC01085-204ENST00000511200 739 ntTSL 27.94□□□□□ -1.142e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LINC01085-205ENST00000512754 823 ntTSL 1 (best)7.94□□□□□ -1.142e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.162e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MXI1-209ENST00000484030 838 ntTSL 57.73□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LONRF1-202ENST00000524526 1246 ntTSL 27.65□□□□□ -1.182e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ZBTB38-212ENST00000510726 859 ntTSL 37.49□□□□□ -1.212e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.222e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LINC01085-202ENST00000506739 1184 ntTSL 1 (best)7.4□□□□□ -1.222e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.242e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 GUF1-202ENST00000506793 3970 ntTSL 57.28□□□□□ -1.244e-8■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.262e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ZFR-206ENST00000510369 1551 ntTSL 1 (best)7.16□□□□□ -1.267e-24■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.32e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 BCO2-207ENST00000525175 588 ntTSL 56.88□□□□□ -1.312e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 BCO2-216ENST00000532673 619 ntTSL 26.88□□□□□ -1.312e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.322e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.332e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.332e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.332e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.347e-24■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 COG5-206ENST00000468350 581 ntTSL 36.66□□□□□ -1.342e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 NIT2-206ENST00000480073 625 ntTSL 36.62□□□□□ -1.352e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC1-204ENST00000571947 306 ntTSL 36.6□□□□□ -1.352e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 AC009119.2-203ENST00000566309 583 ntTSL 26.58□□□□□ -1.362e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 COG5-204ENST00000462342 577 ntTSL 36.4□□□□□ -1.382e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 EXOC4-211ENST00000478265 595 ntTSL 46.32□□□□□ -1.47e-24■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.412e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 EHBP1-208ENST00000427809 581 ntTSL 45.95□□□□□ -1.464e-8■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CBR4-206ENST00000509108 546 ntTSL 35.91□□□□□ -1.462e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MED4-204ENST00000495013 460 ntTSL 35.8□□□□□ -1.482e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.157e-24■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.232e-19■■■■■ 298
UTP3Q9NQZ2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.112e-19■■■■■ 298
UTP3Q9NQZ2 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-19■■■■■ 298
UTP3Q9NQZ2 FEZ2-210ENST00000451623 1869 ntTSL 1 (best)26.72■■□□□ 1.878e-17■■■■■ 297.9
UTP3Q9NQZ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.818e-17■■■■■ 297.9
UTP3Q9NQZ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.648e-17■■■■■ 297.9
UTP3Q9NQZ2 FEZ2-202ENST00000357996 847 ntTSL 55.47□□□□□ -1.538e-17■■■■■ 297.9
UTP3Q9NQZ2 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 297.8
UTP3Q9NQZ2 WWP2-203ENST00000544162 2723 ntTSL 211.57□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 297.8
UTP3Q9NQZ2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 297.8
UTP3Q9NQZ2 OSBPL3-210ENST00000415952 568 ntTSL 415.01□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 297.8
UTP3Q9NQZ2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 297.5
UTP3Q9NQZ2 ARRB1-211ENST00000533255 551 ntTSL 212.12□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 297.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-11■■■■■ 297.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF782-207ENST00000498811 698 ntTSL 311.49□□□□□ -0.572e-11■■■■■ 297.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF782-201ENST00000289032 2355 ntTSL 27.58□□□□□ -1.22e-11■■■■■ 297.1
UTP3Q9NQZ2 VPS53-218ENST00000575207 575 ntTSL 417.16■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 296.9
UTP3Q9NQZ2 VPS53-219ENST00000576019 613 ntTSL 37.99□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 296.9
UTP3Q9NQZ2 DNAAF5-203ENST00000437419 585 ntTSL 521.69■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 296.8
UTP3Q9NQZ2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.481e-7■■■■■ 296.3
UTP3Q9NQZ2 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 328.1■■■□□ 2.092e-6■■■■■ 296.2
UTP3Q9NQZ2 MAPK12-209ENST00000497036 6248 ntTSL 222.46■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 296
UTP3Q9NQZ2 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 313.51□□□□□ -0.255e-8■■■■■ 295.2
UTP3Q9NQZ2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.167e-28■■■■■ 295
UTP3Q9NQZ2 KIAA0319L-202ENST00000373266 2377 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.247e-28■■■■■ 295
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