Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC4Q9NPG8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC4Q9NPG8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms