Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMB3Q9NPA1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMB3Q9NPA1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMB3Q9NPA1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMB3Q9NPA1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMB3Q9NPA1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMB3Q9NPA1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMB3Q9NPA1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNMB3Q9NPA1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNMB3Q9NPA1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNMB3Q9NPA1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNMB3Q9NPA1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNMB3Q9NPA1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNMB3Q9NPA1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNMB3Q9NPA1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNMB3Q9NPA1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNMB3Q9NPA1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNMB3Q9NPA1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNMB3Q9NPA1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms