Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA8Q9NP80 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms