Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM8AQ9HCN3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms