Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf49Q9H6J7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf49Q9H6J7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms