Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX5Q9H2C1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX5Q9H2C1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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