Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD4Q9H223 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms