Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE41Q9C0J9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms