Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM9Q9C026 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms