Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4AQ9BY43 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4AQ9BY43 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms