Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG6Q9BXT2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG6Q9BXT2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG6Q9BXT2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG6Q9BXT2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG6Q9BXT2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG6Q9BXT2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG6Q9BXT2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG6Q9BXT2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms