Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms