Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP23Q9BRU9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UTP23Q9BRU9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UTP23Q9BRU9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP23Q9BRU9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP23Q9BRU9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP23Q9BRU9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP23Q9BRU9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms