Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP3Q9BQQ7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP3Q9BQQ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms