Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms