Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHP1Q99653 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms