Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms