Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT8L2Q96SF2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT8L2Q96SF2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCT8L2Q96SF2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCT8L2Q96SF2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCT8L2Q96SF2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCT8L2Q96SF2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCT8L2Q96SF2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCT8L2Q96SF2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8L2Q96SF2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms