Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3IPQ96QF0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3IPQ96QF0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 575.2 ms