Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms