Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
GBP4Q96PP9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP4Q96PP9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms