Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms